Аннотация:
Для решения задач современной иммунологии широко применяется математическое моделирование. В данной работе мы описали задачу моделирования динамики численностей популяций клеток при ВИЧ-инфекции, на примере которой рассмотрели основные этапы построения и идентификации моделей. Были изучены модели возрастающей степени сложности, описывающие различные аспекты заболевания (клеточный и гуморальный иммунный ответ, антигенпрезентирование, динамика регуляторных Т-лимфоцитов). Была представлена модификация модели инфекционного заболевания Марчука–Петрова для описания ВИЧ-инфекции, учитывающая запаздывание, при оценивании параметров которой был проведён сравнительный анализ численных методов оптимизации. Для рассмотренных моделей была сформулирована и решена задача оценивания параметров по клиническим данным с использованием двух моделей ошибок наблюдений, а также проведено исследование глобальной чувствительности. Был проведен сравнительный анализ качества приближения экспериментальных данных по критерию значений функционала невязки и на основе информационно-теоретического подхода.
Ключевые слова:
mathematical modelling, global sensitivity analysis, parameter estimation, global optimization.
Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 18-31-00356 и проекта РФФИ № 17-01-00636.
Материал поступил в редакцию 28.12.2018, опубликован 06.02.2019
Тип публикации:
Статья
УДК:
51.76
Образец цитирования:
В. В. Желткова, Д. А. Желтков, Г. А. Бочаров, “Моделирование ВИЧ инфекции: идентификация моделей и исследование глобальной чувствительности”, Матем. биология и биоинформ., 14:1 (2019), 19–33
\RBibitem{ZheZheBoc19}
\by В.~В.~Желткова, Д.~А.~Желтков, Г.~А.~Бочаров
\paper Моделирование ВИЧ инфекции: идентификация моделей и исследование глобальной чувствительности
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2019
\vol 14
\issue 1
\pages 19--33
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb370}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2019.14.19}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb370
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i1/p19
Эта публикация цитируется в следующих 4 статьяx:
Zheltkov D., Tyrtyshnikov E., “Global Optimization Based on Tt-Decomposition”, Russ. J. Numer. Anal. Math. Model, 35:4 (2020), 247–261
Sklyarova V E., Nechepurenko Yu.M., Bocharov G.A., “Numerical Steady State Analysis of the Marchuk-Petrov Model of Antiviral Immune Response”, Russ. J. Numer. Anal. Math. Model, 35:2 (2020), 95–110
V. V. Zheltkova, Dmitry A. Zheltkov, G. A. Bocharov, Eugene Tyrtyshnikov, Lecture Notes in Computer Science, 11958, Large-Scale Scientific Computing, 2020, 203
N. I. ARALOVA, “MATHEMATICAL MODELLING OF IMMUNE PROCESSES AND ITS APPLICATION”, Biotechnol.acta, 13:5 (2020), 5