|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Переводы опубликованных статей
REP-elements of the Escherichia coli genome and transcription signals: positional and functional analysis
[REP-элементы генома Escherichia coli и сигналы транскрипции: позиционный и функциональный анализ]
N. Yu. Markelovaab, I. S. Masulisab, O. N. Ozolineab a Institute of Cell Biophysics, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
b Pushchino State Institute of Natural Sciences, Pushchino, Russia
Аннотация:
В межгенных участках генома кишечной палочки находится 356 участков, содержащих от 1 до 12 повторяющихся последовательностей с вырожденным консенсусом, названных REP-элементами. Их биологическая роль мало понятна, но множественность в геноме, преимущественная локализация между конвергентными генами и способность формировать шпилечные структуры послужили основанием для предположения об участии REP-элементов в терминации транскрипции или стабилизации соответствующих РНК, хотя прямые эксперименты не подтвердили способность модельных REP-элементов останавливать синтез РНК. В данной работе позиционный и функциональный анализ, выполненный для всей совокупности аннотированных REP-элементов, позволил установить факт снижения эффективности сквозного синтеза РНК для многих REP-модулей. Однако часть из них не влияла на процессивность транскрипции, что предполагает возможность регуляторного действия REP-элементов в составе РНК. Были также обнаружены REP-последовательности, после которых синтез РНК усиливался и найдены перекрывающиеся с ними промоторы. Выявлен особый характер расположения REP-элементов относительно промоторных островков, предполагающий вклад повторяющихся модулей в транскрипционную изоляцию островков и их функциональную автономию, а также биологическое значение островковых РНК.
Ключевые слова:
структурные элементы бактериального генома, REP-элементы, промоторы, промоторные островки, механизмы регуляции транскрипции.
Материал поступил в редакцию 22.03.2016, опубликован 28.03.2016
Образец цитирования:
N. Yu. Markelova, I. S. Masulis, O. N. Ozoline, “REP-elements of the Escherichia coli genome and transcription signals: positional and functional analysis”, Матем. биология и биоинформ., 11, Suppl. (2016), t1–t14
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb317 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v11/i3/p1
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 174 | PDF полного текста: | 46 | Список литературы: | 21 |
|