Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2016, том 11, выпуск Suppl., страницы t1–t14
DOI: https://doi.org/10.17537/2016.11.t1
(Mi mbb317)
 

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Переводы опубликованных статей

REP-elements of the Escherichia coli genome and transcription signals: positional and functional analysis
[REP-элементы генома Escherichia coli и сигналы транскрипции: позиционный и функциональный анализ]

N. Yu. Markelovaab, I. S. Masulisab, O. N. Ozolineab

a Institute of Cell Biophysics, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
b Pushchino State Institute of Natural Sciences, Pushchino, Russia
Список литературы:
Аннотация: В межгенных участках генома кишечной палочки находится 356 участков, содержащих от 1 до 12 повторяющихся последовательностей с вырожденным консенсусом, названных REP-элементами. Их биологическая роль мало понятна, но множественность в геноме, преимущественная локализация между конвергентными генами и способность формировать шпилечные структуры послужили основанием для предположения об участии REP-элементов в терминации транскрипции или стабилизации соответствующих РНК, хотя прямые эксперименты не подтвердили способность модельных REP-элементов останавливать синтез РНК. В данной работе позиционный и функциональный анализ, выполненный для всей совокупности аннотированных REP-элементов, позволил установить факт снижения эффективности сквозного синтеза РНК для многих REP-модулей. Однако часть из них не влияла на процессивность транскрипции, что предполагает возможность регуляторного действия REP-элементов в составе РНК. Были также обнаружены REP-последовательности, после которых синтез РНК усиливался и найдены перекрывающиеся с ними промоторы. Выявлен особый характер расположения REP-элементов относительно промоторных островков, предполагающий вклад повторяющихся модулей в транскрипционную изоляцию островков и их функциональную автономию, а также биологическое значение островковых РНК.
Ключевые слова: структурные элементы бактериального генома, REP-элементы, промоторы, промоторные островки, механизмы регуляции транскрипции.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 14-14-00985
The study was supported by the grant of the Russian Scientific Foundation (project №14-14-00985).
Материал поступил в редакцию 22.03.2016, опубликован 28.03.2016
Тип публикации: Статья
УДК: 579:252
Язык публикации: английский
Образец цитирования: N. Yu. Markelova, I. S. Masulis, O. N. Ozoline, “REP-elements of the Escherichia coli genome and transcription signals: positional and functional analysis”, Матем. биология и биоинформ., 11, Suppl. (2016), t1–t14
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{MarMasOzo16}
\by N.~Yu.~Markelova, I.~S.~Masulis, O.~N.~Ozoline
\paper REP-elements of the \emph{Escherichia coli} genome and transcription signals: positional and functional analysis
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2016
\vol 11
\pages t1--t14
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb317}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2016.11.t1}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb317
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v11/i3/p1
    Перевод статьи
    Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:174
    PDF полного текста:46
    Список литературы:21
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024