|
Переводы опубликованных статей
Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome
[Интеграция чужеродного генетического материала провоцирует локальный мутагенез в геноме бактерии-реципиента]
O. A. Glazunovaa, K. S. Shavkunova, M. N. Tutukinaa, V. V. Panyukovb, O. N. Ozolinea a 142290, Institute of Cell Biophysics of Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow
Region, Russian Federation
b 142290, Institute of Mathematical Problems of Biology – the Branch of Keldysh Institute of
Applied Mathematics of Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, Russian
Federation
Аннотация:
Обмен генетической информацией является одним из основных факторов бактериальной эволюции, но механизмы интеграции горизонтально перенесённых генов в регуляторные сети нового хозяина остаются практически не исследованными. Данная работа посвящена изучению этого адаптационного процесса, в том числе, участия в нём транскрипционного аппарата бактериальных клеток. Для этого два чужих гена в геноме Escherichia coli K12 MG1655 были заменены на новые копии из геномов предполагаемых доноров и начат хронический рост мутантных и контрольных культур. Через 2000 (для гена sfmA) и 4000 (для гена ydhZ) генераций было проведено популяционное секвенирование ампликонов модифицированных и исходных участков генома, с последующим анализом обнаруженных в них спонтанных мутаций. Установлено, что в модифицированных участках чаще, чем в немодифицированных, возникают замены G/C-пар на A/T-пары, а замены A/T $\to$ G/C, наоборот, наблюдаются реже. Это значит, что в ответ на введение чужеродного генетического материала в геноме возникает адаптивная реакция, направленная на обогащение модифицированного участка A/T-парами. В процессе длительной эволюции это может привести как к «замалчиванию» нежелательного гена с участием специфического супрессора чужеродных генов H-NS, так и к созданию приемлемого для адекватной экспрессии промотора в составе промоторного островка.
Ключевые слова:
бактериальная эволюция, горизонтальный перенос генов, однонуклеотидный полиморфизм, промоторные островки.
Материал поступил в редакцию 22.02.2017, опубликован 06.03.2017
Образец цитирования:
O. A. Glazunova, K. S. Shavkunov, M. N. Tutukina, V. V. Panyukov, O. N. Ozoline, “Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome”, Матем. биология и биоинформ., 12, Suppl. (2017), t12–t22
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb315 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i3/p12
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 162 | PDF полного текста: | 34 | Список литературы: | 28 |
|