Аннотация:
Влияние торсионного момента на движение кинка ДНК исследуется методами математического моделирования. Найдены временные зависимости координаты, скорости, размера и энергии кинка при разных значениях параметров внешнего торсионного момента. Показано, что изменяя эти параметры, включая и выключая внешнее воздействие, можно регулировать скорость и направление движения кинка. Приводится оценка значения торсионного момента, необходимого для движения кинка (открытого состояния) со скоростью, сравнимой со скоростью транскрипции.
Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 15-34-50665 мол_нр.
Материал поступил в редакцию 21.03.2016, 30.03.2016, опубликован 18.04.2016
Тип публикации:
Статья
УДК:
577.323
Образец цитирования:
Л. В. Якушевич, В. Н. Балашова, Ф. К. Закирьянов, “О движении кинка ДНК под действием постоянного торсионного момента”, Матем. биология и биоинформ., 11:1 (2016), 81–90
\RBibitem{YakBalZak16}
\by Л.~В.~Якушевич, В.~Н.~Балашова, Ф.~К.~Закирьянов
\paper О движении кинка ДНК под действием постоянного торсионного момента
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2016
\vol 11
\issue 1
\pages 81--90
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb252}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2016.11.81}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb252
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v11/i1/p81
Эта публикация цитируется в следующих 14 статьяx:
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Низкоплотные составляющие холстейновского полярона при его равномерном движении в постоянном электрическом поле в начальный период времени”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2022, 078, 19 с.
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Возникновение внутренней динамики холстейновского полярона в процессе его равномерного движения в полинуклеотидной цепочке в постоянном электрическом поле”, Матем. биология и биоинформ., 17:2 (2022), 452–464
A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 9, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2022
A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, “Dependence of the nature of the Holstein polaron motion in a polynucleotide chain subjected to a constant electric field on the initial polaron state and the parameters of the chain”, J. Phys.: Conf. Ser., 2155:1 (2022), 012031
Slobodan Zdravković, Nonlinear Dynamics of Nanobiophysics, 2022, 29
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Зависимость движения заряда в постоянном электрическом поле в полинуклеотидных цепочках от значения константы связи заряда со смещениями цепочки”, Матем. биология и биоинформ., 17, Suppl. (2022), 1–13
A. N. Korshounova, V. D. Lakhno, “The incipient formation of the internal dynamics of a uniformly moving polaron in a polynucleotide chain subjected to a constant electric field”, Матем. биология и биоинформ., 17, Suppl. (2022), 42–52
О. Н. Шабловский, “Волновое уравнение с кубической нелинейностью и возбуждение колебаний в системе «среда-источник»”, Вестн. Южно-Ур. ун-та. Сер. Матем. Мех. Физ., 13:4 (2021), 44–56
Ludmila V. Yakushevich, Larisa A. Krasnobaeva, “Ideas and methods of nonlinear mathematics and theoretical physics in DNA science: the McLaughlin-Scott equation and its application to study the DNA open state dynamics”, Biophys Rev, 13:3 (2021), 315
A. N. Korshounova, V. D. Lakhno, “Charge motion along polynucleotide chains in a constant electric field depends on the charge coupling constant with chain displacements”, Матем. биология и биоинформ., 16:2 (2021), 411–421
Chevizovich D. Michieletto D. Mvogo A. Zakiryanov F. Zdravkovic S., “A Review on Nonlinear Dna Physics”, R. Soc. Open Sci., 7:11 (2020), 200774
Л. В. Якушевич, В. Н. Балашова, Ф. К. Закирьянов, “Особенности движения кинков ДНК при асинхронном включении/выключении постоянного и периодического полей”, Компьютерные исследования и моделирование, 10:4 (2018), 545–558
M. I. Drobotenko, S. S. Dzhimak, A. A. Svidlov, A. A. Basov, O. M. Lyasota, M. G. Baryshev, “A Mathematical Model for Basepair Opening in a DNA Double Helix”, BIOPHYSICS, 63:2 (2018), 177
L. V. Yakushevich, L. A. Krasnobaeva, “Analytical Approaches to Investigating the Dynamics of Genes with a Single Coding Region”, BIOPHYSICS, 63:1 (2018), 31
Цитирование в формате AMSBIB
Обратная связь: