Аннотация:
Предложена концепция «активных» молекулярных моделей. Разработана программа Maya-K-PDB для построения «активных» молекулярных моделей в среде 3D редактора Maya. В комплексе с вышеназванным редактором, программа предоставляет исследователю обширные возможности для динамической визуализации и моделирования конформационных изменений биологических макромолекул, а также сложных процессов, происходящих на молекулярном уровне. Описан управляющий интерфейс Maya-K-PDB. Все основные возможности разработанной программы продемонстрированы на ряде примеров.
Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, грант № 14-04-01198 "Молекулярное моделированиe структурных особенностей и механизмов активации бета2-адренорецептора", проектов РФФИ 13-07-00162, 13-07-12183, 14-07-00636 и Программы фундаментальных исследований 43П Президиума Российской академии наук.
Материал поступил в редакцию 15.12.2014, опубликован 29.06.2015
Тип публикации:
Статья
УДК:
577.29
Образец цитирования:
С. В. Филиппов, В. С. Сивожелезов, В. Л. Ким, В. В. Сычев, М. Н. Устинин, “Программа трехмерного моделирования и визуализации конформационной динамики биомакромолекул Maya-K-PDB”, Матем. биология и биоинформ., 10:1 (2015), 260–282
\RBibitem{FilSivKim15}
\by С.~В.~Филиппов, В.~С.~Сивожелезов, В.~Л.~Ким, В.~В.~Сычев, М.~Н.~Устинин
\paper Программа трехмерного моделирования и визуализации конформационной динамики биомакромолекул Maya-K-PDB
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 1
\pages 260--282
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb225}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.260}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb225
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i1/p260
Эта публикация цитируется в следующих 5 статьяx:
С. В. Филиппов, “Метод идентификации атомов макромолекул, визуализируемых в 3D редакторах”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2019, 097, 10 с.
I. V. Florinsky, S. V. Filippov, “Three-dimensional terrain modeling with multiple-source illumination”, Trans. GIS, 23:5 (2019), 937–959
С. В. Филиппов, “Программная платформа Blender как среда моделирования объектов и процессов естественно-научных дисциплин”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 230, 42 с.
S.V. Filippov, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 7, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2018
S.V. Filippov, V.S. Sivozhelezov, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 7, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2018
Цитирование в формате AMSBIB
Обратная связь: