Аннотация:
Основным ферментом, метаболизирующим нитрит в клетках E. coli при низких концентрациях субстрата в среде, является периплазматическая Nrf нитритредуктаза. Ранее нами была разработана модель утилизации нитрита клетками E. coli при культивировании их в условиях стационарного роста в проточном хемостате, которая учитывала динамику экспрессии nrf и nir оперонов, кодирующих структуру ферментов, метаболизирующих и транспортирующих нитрит. Анализ модели показал, что для описания кинетики накопления нитрита в хемостате в области микромолярных концентраций нитрита требуется введение в модель дополнительного предположения о наличии в клетке более высокого уровня утилизации нитрита, чем это следует из генетических исследований. В настоящей работе мы показали, что существующее противоречие между результатами генетических и физиологических исследований в области низких концентраций нитрита может быть объяснено свойствами Nrf фермента, каталитическая активность и стабильность которого зависят от его локализации в периплазме, а возможность секреции белка в периплазму определяется наличием на мембране электрического потенциала. Анализ модели показал, что при низких концентрациях нитрита локальное изменение концентрации фермента при переходе из цитоплазмы в периплапазматическое пространство клетки под действием мембранного потенциала достаточно для формирования более высокой активности NrfA редуктазы в периплазме, чем это можно было ожидать, исходя из данных по уровню экспрессии nrf оперона.
Работа выполнена при финансовой поддержке Российского Научного Фонда (грант № 14-24-00123).
Материал поступил в редакцию 06.04.2015, опубликован 26.05.2015
Тип публикации:
Статья
УДК:
001.575:577.218:579.84:57.017.723
Образец цитирования:
Н. А. Ри, В. А. Лихошвай, Т. М. Хлебодарова, “О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста”, Матем. биология и биоинформ., 10:1 (2015), 193–205
\RBibitem{RiLikKhl15}
\by Н.~А.~Ри, В.~А.~Лихошвай, Т.~М.~Хлебодарова
\paper О механизмах утилизации нитрита клетками \emph{Escherichia coli} при культивировании их в условиях стационарного роста
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 1
\pages 193--205
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb220}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.193}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb220
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i1/p193
Эта публикация цитируется в следующих 3 статьяx:
Н. А. Ри, В. А. Лихошвай, Т. М. Хлебодарова, “Мембранный потенциал как механизм регуляции активности периплазматической нитритредуктазы: математическая модель”, Матем. биология и биоинформ., 13:1 (2018), 238–269
N.A. Ree, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 7, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2018
Tamara M. Khlebodarova, Nataly A. Ree, Vitaly A. Likhoshvai, “On the control mechanisms of the nitrite level in Escherichia coli cells: the mathematical model”, BMC Microbiol, 16:S1 (2016)