Loading [MathJax]/jax/output/SVG/config.js
Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2015, том 10, выпуск 1, страницы 193–205
DOI: https://doi.org/10.17537/2015.10.193
(Mi mbb220)
 

Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)

Математическое моделирование

О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста

Н. А. Риa, В. А. Лихошвайab, Т. М. Хлебодароваa

a Институт цитологии и генетики, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск, 630090, Россия
b Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, 630090, Россия
Список литературы:
Аннотация: Основным ферментом, метаболизирующим нитрит в клетках E. coli при низких концентрациях субстрата в среде, является периплазматическая Nrf нитритредуктаза. Ранее нами была разработана модель утилизации нитрита клетками E. coli при культивировании их в условиях стационарного роста в проточном хемостате, которая учитывала динамику экспрессии nrf и nir оперонов, кодирующих структуру ферментов, метаболизирующих и транспортирующих нитрит. Анализ модели показал, что для описания кинетики накопления нитрита в хемостате в области микромолярных концентраций нитрита требуется введение в модель дополнительного предположения о наличии в клетке более высокого уровня утилизации нитрита, чем это следует из генетических исследований. В настоящей работе мы показали, что существующее противоречие между результатами генетических и физиологических исследований в области низких концентраций нитрита может быть объяснено свойствами Nrf фермента, каталитическая активность и стабильность которого зависят от его локализации в периплазме, а возможность секреции белка в периплазму определяется наличием на мембране электрического потенциала. Анализ модели показал, что при низких концентрациях нитрита локальное изменение концентрации фермента при переходе из цитоплазмы в периплапазматическое пространство клетки под действием мембранного потенциала достаточно для формирования более высокой активности NrfA редуктазы в периплазме, чем это можно было ожидать, исходя из данных по уровню экспрессии nrf оперона.
Ключевые слова: моделирование, регуляция экспрессии генов, Escherichia coli, анаэробное дыхание, нитритредуктазы.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 14-24-00123
Работа выполнена при финансовой поддержке Российского Научного Фонда (грант № 14-24-00123).
Материал поступил в редакцию 06.04.2015, опубликован 26.05.2015
Тип публикации: Статья
УДК: 001.575:577.218:579.84:57.017.723
Образец цитирования: Н. А. Ри, В. А. Лихошвай, Т. М. Хлебодарова, “О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста”, Матем. биология и биоинформ., 10:1 (2015), 193–205
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{RiLikKhl15}
\by Н.~А.~Ри, В.~А.~Лихошвай, Т.~М.~Хлебодарова
\paper О механизмах утилизации нитрита клетками \emph{Escherichia coli} при культивировании их в условиях стационарного роста
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 1
\pages 193--205
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb220}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.193}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb220
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i1/p193
  • Эта публикация цитируется в следующих 3 статьяx:
    1. Н. А. Ри, В. А. Лихошвай, Т. М. Хлебодарова, “Мембранный потенциал как механизм регуляции активности периплазматической нитритредуктазы: математическая модель”, Матем. биология и биоинформ., 13:1 (2018), 238–269  mathnet  crossref
    2. N.A. Ree, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 7, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2018  crossref
    3. Tamara M. Khlebodarova, Nataly A. Ree, Vitaly A. Likhoshvai, “On the control mechanisms of the nitrite level in Escherichia coli cells: the mathematical model”, BMC Microbiol, 16:S1 (2016)  crossref
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:306
    PDF полного текста:82
    Список литературы:77
     
      Обратная связь:
    math-net2025_05@mi-ras.ru
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025