|
Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)
Математическое моделирование
О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста
Н. А. Риa, В. А. Лихошвайab, Т. М. Хлебодароваa a Институт цитологии и генетики, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск, 630090, Россия
b Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, 630090, Россия
Аннотация:
Основным ферментом, метаболизирующим нитрит в клетках E. coli при низких концентрациях субстрата в среде, является периплазматическая Nrf нитритредуктаза. Ранее нами была разработана модель утилизации нитрита клетками E. coli при культивировании их в условиях стационарного роста в проточном хемостате, которая учитывала динамику экспрессии nrf и nir оперонов, кодирующих структуру ферментов, метаболизирующих и транспортирующих нитрит. Анализ модели показал, что для описания кинетики накопления нитрита в хемостате в области микромолярных концентраций нитрита требуется введение в модель дополнительного предположения о наличии в клетке более высокого уровня утилизации нитрита, чем это следует из генетических исследований. В настоящей работе мы показали, что существующее противоречие между результатами генетических и физиологических исследований в области низких концентраций нитрита может быть объяснено свойствами Nrf фермента, каталитическая активность и стабильность которого зависят от его локализации в периплазме, а возможность секреции белка в периплазму определяется наличием на мембране электрического потенциала. Анализ модели показал, что при низких концентрациях нитрита локальное изменение концентрации фермента при переходе из цитоплазмы в периплапазматическое пространство клетки под действием мембранного потенциала достаточно для формирования более высокой активности NrfA редуктазы в периплазме, чем это можно было ожидать, исходя из данных по уровню экспрессии nrf оперона.
Ключевые слова:
моделирование, регуляция экспрессии генов, Escherichia coli, анаэробное дыхание, нитритредуктазы.
Материал поступил в редакцию 06.04.2015, опубликован 26.05.2015
Образец цитирования:
Н. А. Ри, В. А. Лихошвай, Т. М. Хлебодарова, “О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста”, Матем. биология и биоинформ., 10:1 (2015), 193–205
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb220 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i1/p193
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 254 | PDF полного текста: | 63 | Список литературы: | 59 |
|