Эта публикация цитируется в 4 научных статьях (всего в 4 статьях)
Биоинформатика
A search for relict ribonucleotide and amino acid sequences that played a key role in the development of the ribosome and modern protein diversity
[Поиск реликтовых рибонуклеотидных и аминокислотных последовательностей, игравших ключевую роль в формировании рибосомы и современного разнообразия белков]
Аннотация:
Представлены результаты анализа базы данных белковых последовательностей прокариотических микроорганизмов, выявившего наличие элементов консервативной пептидной последовательности длиной 11 аминокислотных остатков в 20 локусах 16 функционально и филогенетически различных консервативных белков у представителей различных таксонов. Этот аминокислотный мотив IKAVRELGLER, возможно, является одним из последних общих предшественников матрично-синтезируемых пептидов (Last Universal Peptide Ancestors, LUPA). Источником генетической информации такой последовательности, по всей вероятности, служит фрагмент рибосомной РНК (участок A-сайта, включающий ветви H92, H90 и H93 пептидил-трансферазного центра), транслированный с одной из возможных рамок считывания. Такой фрагмент рРНК, исполнявший функцию матрицы для синтеза LUPA, назван нами последним общим РНК-предшественником (Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA). Предполагается, что LURNA и транслируемые с него пептидные продукты послужили источником формирования современного разнообразия пептидов.
Ключевые слова:
рибосома, рибосомная РНК, трансляция, пептидил-трансферазный центр, универсальный пептидный мотив, Last Universal Peptide Ancestor, LUPA, Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA.
This study was partially supported by RFBR (grant № 13-04-00991).
Материал поступил в редакцию 30.03.2015, опубликован 08.04.2015
Тип публикации:
Статья
УДК:
577.217.347
Язык публикации: английский
Образец цитирования:
N. E. Skoblikov, A. A. Zimin, “A search for relict ribonucleotide and amino acid sequences that played a key role in the development of the ribosome and modern protein diversity”, Матем. биология и биоинформ., 10:1 (2015), 116–130
\RBibitem{SkoZim15}
\by N.~E.~Skoblikov, A.~A.~Zimin
\paper A search for relict ribonucleotide and amino acid sequences that played a key role in the development of the ribosome and modern protein diversity
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 1
\pages 116--130
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb215}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.116}
Н. Н. Назипова, “Разнообразие некодирующих РНК в геномах эукариот”, Матем. биология и биоинформ., 16:2 (2021), 256–298
Nikolai E. Skoblikow, Andrei A. Zimin, “Mineral Grains, Dimples, and Hot Volcanic Organic Streams: Dynamic Geological Backstage of Macromolecular Evolution”, J Mol Evol, 86:3-4 (2018), 172
Nikolai E. Skoblikow, Andrei A. Zimin, “Hypothesis of Lithocoding: Origin of the Genetic Code as a “Double Jigsaw Puzzle” of Nucleobase-Containing Molecules and Amino Acids Assembled by Sequential Filling of Apatite Mineral Cellules”, J Mol Evol, 82:4-5 (2016), 163
V. S. Bystrov, E. V. Paramonova, A. V. Bystrova, V. E. Gevorkyan, X. J. Meng, B. B. Tian, J. L. Wang, L. A. Avakyan, “Анализ вычислительных и экспериментальных исследований переключения поляризации в ПВДФ и П (ВДФ-ТрФЭ) сегнетоэлектрических пленках на наноуровне”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 372–386
Цитирование в формате AMSBIB
Обратная связь: