A search for relict ribonucleotide and amino acid sequences that played a key role in the development of the ribosome and modern protein diversity

Представлены результаты анализа базы данных белковых последовательностей прокариотических микроорганизмов, выявившего наличие элементов консервативной пептидной последовательности длиной 11 аминокислотных остатков в 20 локусах 16 функционально и филогенетически различных консервативных белков у представителей различных таксонов. Этот аминокислотный мотив IKAVRELGLER, возможно, является одним из последних общих предшественников матрично-синтезируемых пептидов (Last Universal Peptide Ancestors, LUPA). Источником генетической информации такой последовательности, по всей вероятности, служит фрагмент рибосомной РНК (участок A-сайта, включающий ветви H92, H90 и H93 пептидил-трансферазного центра), транслированный с одной из возможных рамок считывания. Такой фрагмент рРНК, исполнявший функцию матрицы для синтеза LUPA, назван нами последним общим РНК-предшественником (Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA). Предполагается, что LURNA и транслируемые с него пептидные продукты послужили источником формирования современного разнообразия пептидов.