|
Математическая биология и биоинформатика, 2014, том 9, выпуск 2, страницы 386–395
(Mi mbb186)
|
|
|
|
Биоинформатика
Выявление связи «структура — биологическая активность» на основе конформационного анализа стереоизомеров брассиностероидов методами молекулярного моделирования
В. М. Андриановa, И. В. Анищенкоb a Институт физики им. Б. И. Степанова, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220072, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
Аннотация:
Методами молекулярной механики и квантовой химии в приближении теории функционала плотности проведен конформационный анализ одного из наиболее биологически активных соединений класса брассиностероидов — природного брассинолида, — и менее активных — природного 24-эпибрассинолида, синтетических (22S,23S)-24-эпибрассинолида и (22S,23S)-гомобрассинолида с последующим сопоставлением структур их боковых цепей. Установлено, что конфигурация 22R,23R,24S двух гидроксилов и метильной группы брассинолида обеспечивает структуры боковой цепи, в которых ее диольная система образует внутримолекулярную водородную связь O6…H(O5). При этом гидроксил О6Н свободен и может участвовать в формировании межмолекулярных водородных связей с рецептором. Напротив, 22S,23S,24R-конфигурация наименее биоактивного (22S,23S)-24-эпибрассинолида отвечает структурам боковой цепи, в которых гидроксил О6Н экранирован 21-метил группой. Показано, что важным фактором высокой биоактивности брассиностероидов также является изогнутость их боковой цепи по направлению к $\beta$-стороне остова стероида.
Ключевые слова:
брассиностероиды, конформеры, биологическая активность, конформационный анализ, боковая цепь, водородная связь, компьютерное моделирование.
Материал поступил в редакцию 23.09.2014, опубликован 11.11.2014
Образец цитирования:
В. М. Андрианов, И. В. Анищенко, “Выявление связи «структура — биологическая активность» на основе конформационного анализа стереоизомеров брассиностероидов методами молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 386–395
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb186 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i2/p386
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 219 | PDF полного текста: | 62 | Список литературы: | 36 |
|