|
Математическая биология и биоинформатика, 2014, том 9, выпуск 2, страницы 504–517
(Mi mbb185)
|
|
|
|
Математическое моделирование
Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы
И. Р. Акбердинa, Н. В. Иванисенкоa, Ф. В. Казанцевa, Е. А. Ощепковаa, Н. А. Омельянчукa, Ю. Г. Матушкинba, Д. А. Афонниковba a Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, 630090, Россия
b Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, 630090, Россия
Аннотация:
В работе представлены результаты анализа кинетической и стохастической моделей, описывающих динамику функционирования коровой генной сети поддержания плюрипотентности и дифференцировки эмбриональных стволовых клеток, с учетом последних экспериментальных данных о регуляции экспрессии Nanog. Анализ кинетической модели показал, что в динамике изменения концентрации как мРНК, так и белка Nanog потенциально может существовать осциллирующий режим функционирования, что может объяснять наблюдаемую в экспериментах гетерогенность экспрессии Nanog в популяции столовых клеток. Стохастический подход, в свою очередь, позволил выявить диапазон параметров, при котором в результате стохастических флуктуаций существует два возможных состояния системы: с высоким и низким уровнями экспрессии Oct4, Sox2 и Nanog. При этом возможен спонтанный переход из одного состояния в другое, что также может являться одним из механизмов гетерогенности экспрессии Nanog.
Ключевые слова:
плюрипотентное состояние, дифференцировка, экспрессия гена, гетерогенность Nanog, математическое моделирование.
Материал поступил в редакцию 15.10.2014, опубликован 16.12.2014
Образец цитирования:
И. Р. Акбердин, Н. В. Иванисенко, Ф. В. Казанцев, Е. А. Ощепкова, Н. А. Омельянчук, Ю. Г. Матушкин, Д. А. Афонников, “Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 504–517
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb185 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i2/p504
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 332 | PDF полного текста: | 96 | Список литературы: | 48 |
|