|
Математическая биология и биоинформатика, 2014, том 9, выпуск 1, страницы 89–111
(Mi mbb173)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Математическое моделирование
Computational Analysis of Hysteresis and Bistability in the Mitochondrial Respiratory Chain
[Компьютерный анализ гистерезиса и бистабильности в дыхательной цепи митохондрий]
N. I. Markevichab, J. B. Hoekb a Institute of Theoretical and Experimental Biophysics RAS, Pushchino, 142290, Russia
b Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology, Thomas Jefferson University, Philadelphia, PA 19107, USA
Аннотация:
Количественный анализ бистабильности в работе дыхательной цепи был выполнен с помощью математической модели, представляющей систему 32 обыкновенных дифференциальных уравнений. Детальный численный анализ широкого спектра стационарных состояний в модели выявил механизмы появления гистерезиса и бистабильности в работе дыхательной цепи в условиях окисления НАДН, сукцината и НАДН+сукцинат. Показано, что появление гистерезиса и бистабильности при окислении НАДН и сукцината имеет один и тот же кинетический механизм, а именно, кажущееся субстратное угнетение окисления $\mathrm{QH_2}$ на $\mathrm{Qo}$-сайте комплекса III. Однако, условия возникновения бистабильности при окислении разных субстратов сильно отличаются из-за разной $\mathrm{QH_2}$-зависимости скорости генерации $\mathrm{QH_2}$ в комплексах I и II. Наиболее важными параметрами, которые влияют на появление бистабильности в дыхательной цепи при окислении НАДН и НАДН+сукцинат, являются скорость восстановления НАДН в матриксе и концентрации комплекса I и убихинона во внутренней мембране митохондрий. Детально изучена гипотеза, предложенная ранее Селивановым с коллегами, о том, что бистабильность является причиной экспериментально наблюдаемого сильного увеличения производства активных форм кислорода (АФК) при гипоксии-реоксигенации. Компьютерное моделирование ситуации «гипоксия-реоксигенация» при условии существования бистабильности в модели показывает, что существенный рост производства АФК при реоксигенации наблюдается только при слабых изменениях мембранного потенциала в результате гипоксии. Если же при гипоксии мембранный потенциал сильно падает, удерживая высокую скорость дыхания и окисленное состояние дыхательной цепи, то реоксигенация, следующая после гипоксии, не приводит к изменению скорости производства АФК, существовавшему до гипоксии. Результаты этого исследования предполагают существование другого дополнительного механизма сильного увеличения АФК в митохондриях в результате гипоксии-реоксигенации, приводящего к гибели клеток.
Ключевые слова:
активные формы кислорода (АФК), митохондриальная дыхательная цепь, математическая модель, гистерезис и бистабильность, гипоксия-реоксигенация.
Материал поступил в редакцию 18.02.2014, опубликован 11.03.2014
Образец цитирования:
N. I. Markevich, J. B. Hoek, “Computational Analysis of Hysteresis and Bistability in the Mitochondrial Respiratory Chain”, Матем. биология и биоинформ., 9:1 (2014), 89–111
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb173 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i1/p89
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 292 | PDF полного текста: | 114 | Список литературы: | 59 |
|