Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в глобулярных белках

Рассматривается задача распознавания структурных мотивов белков на примере $\alpha$-$\alpha$-уголков. Предложен комбинированный подход к решению задач анализа пространственной структуры белков на основе аналитического описания основной цепи белковой глобулы и спектрального метода распознавания повторов. Нами найдено 110 $\alpha$-$\alpha$-уголков в базе данных PDB, соответствующих заданному эталону. Методом молекулярной динамики показано, что $\alpha$-$\alpha$-уголки как автономные структуры устойчивы в водной среде.