Моделирование утилизации нитрита клетками Escherichia coli: анализ потоков

Представлены результаты исследования модели, описывающей утилизацию нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в проточном хемостате. Модель учитывает динамику экспрессии nrf и nir оперонов, кодирующих структуру ферментов, метаболизирующих и транспортирующих нитрит. Показано, что адаптированная к экспериментальным данным модель описывает кинетику накопления нитрита в хемостате в области миллимолярных концентраций добавленного в хемостат субстрата без дополнительных предположений. В данной области, согласно модели, поддерживается постоянная внутриклеточная концентрация нитрита, не зависящая от его концентрации в ростовой среде. Для описания кинетики накопления нитрита в хемостате в области микромолярных концентраций добавленного нитрита требуется введение в модель дополнительного предположения о наличии более высокого уровня активности NrfA нитритредуктазы, чем это следует из генетических исследований.