|
Математическая биология и биоинформатика, 2013, том 8, выпуск 1, страницы 119–134
(Mi mbb137)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Биоинформатика
Компьютерный поиск новых анти-ВИЧ-1 агентов — пептидомиметиков нейтрализующих антител — и оценка их потенциальной ингибиторной активности методами молекулярного моделирования
А. М. Андриановa, И. А. Кашинb, А. В. Тузиковb a Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
Аннотация:
На основе анализа структурных комплексов пептидов петли V3 ВИЧ-1 из различных модификаций вируса с Fab-фрагментом моноклонального антитела (МКА) 3074, обладающего широкой нейтрализующей активностью, осуществлен компьютерный поиск химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства антиген-связывающего центра этого антитела. Методами молекулярного докинга оценена эффективность связывания найденных соединений с пептидами петли V3 и проведен отбор наиболее вероятных пептидомиметиков МКА 3074. С помощью методов молекулярной динамики и расчета свободной энергии образования комплексов показано, что, как и МКА 3074, отобранные соединения проявляют высокое сродство к иммуногенной “верхушке” петли V3 ВИЧ-1, образующей консервативный структурный мотив, в состав которого входят критические для клеточного тропизма аминокислоты белка gp120 оболочки вируса. В связи с этим, данные соединения рассматриваются как перспективные базовые структуры для создания новых эффективных лекарственных препаратов против СПИДа.
Ключевые слова:
ВИЧ-1, белок gp120, петля V3, нейтрализующие антитела, пептидомиметики, компьютерное моделирование, анти-ВИЧ агенты.
Материал поступил в редакцию 12.02.2013, опубликован 25.03.2013
Образец цитирования:
А. М. Андрианов, И. А. Кашин, А. В. Тузиков, “Компьютерный поиск новых анти-ВИЧ-1 агентов — пептидомиметиков нейтрализующих антител — и оценка их потенциальной ингибиторной активности методами молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 8:1 (2013), 119–134
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb137 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v8/i1/p119
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 323 | PDF полного текста: | 76 | Список литературы: | 49 | Первая страница: | 1 |
|