Множественные места локализации нуклеосом ассоциированы с участками связывания ДНК с ядерным матриксом

Нами получены карты нуклеосомной локализации для последовательности более 20 фрагментов ДНК, связывающихся с ядерным матриксом. Проведено сравнение карты с локализацией контекстных характеристик (пурин-пиримидиновые тракты, ATG-, ATC-последовательности, повторы мотивов T$_{1\text-5}$G$_{1\text-5}$, C$_{1\text-5}$A$_{1\text-5}$, повторы динуклеотидов TG, CA, TA, мотивы теломерных повторов, AT-богатые последовательности, сайты TopoII-изомеразы). Выяснено, что для участков связывания с ядерным матриксом длиной более 800 п.н. встречаются множественные сильные сайты нуклеосомной локализации, часто последовательно расположенные друг за другом. С ними соседствуют, как правило, зоны пониженного потенциала нуклеосомной локализации. С этими зонами ассоциируется повышенная частота встречаемости контекстных характеристик (пурин-пиримидиновых трактов, T$_{1\text-5}$G$_{1\text-5}$/C$_{1\text-5}$A$_{1\text-5}$-мотивов, ATG-, ATC-последовательностей, повторов пурин-пиримидиновых динуклеотидов, отдельных теломерных повторов, сайтов TopoII-изомеразы). Исключение в представленной выборке составил пример гена бета-глобина человека, интрон которого содержит сайт связывания с ядерным матриксом, некоторые контекстные характеристики, но не имеет близко расположенных сильных сайтов нуклеосомной локализации.