Журнал технической физики
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Правила для авторов

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS


ЖТФ:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти




Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация

Журнал технической физики, 2018, том 88, выпуск 9, страницы 1407–1412
DOI: https://doi.org/10.21883/JTF.2018.09.46429.2621 (Mi jtf5826) 		 
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Разработка приборов и устройства для практических применений

Метод поиска пиков размерного стандарта при фрагментном анализе ДНК

И. В. Заруцкийab, В. В. Манойловab, Н. С. Самсоноваac, А. И. Петровa, В. Е. Курочкинa, И. А. Леонтьевa, Я. И. Алексеевde

a Институт аналитического приборостроения РАН, г. Санкт-Петербург
b Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики
c Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе Российской академии наук, г. Санкт-Петербург
d ЗАО "Синтол", г. Москва
e Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии", г. Москва
PDF полного текста (322 kB) Список цитирования (1)
DOI: https://doi.org/10.21883/JTF.2018.09.46429.2621
Аннотация: Фрагментный анализ ДНК методом капиллярного гель-электрофореза является эффективным инструментом изучения структуры ДНК, имеющим множество областей применения, в частности для генетической экспертизы сортов и сортообразцов ряда важнейших сельскохозяйственных культур. Фрагментный анализ ДНК проводится в несколько этапов. Этап обработки результатов исследования включает процедуру обнаружения пиков стандартных фрагментов ДНК. В работе перечислены особенности спектра распределения стандартных фрагментов ДНК, приводящие к необходимости разработки нового метода поиска пиков стандарта. Предложен метод их поиска, основанный на сопоставлении совокупности стандартных длин фрагментов ДНК и спектральных пиков. Описан алгоритм, реализующий этот метод. Также подробно рассмотрен критический этап алгоритма – выбор порога для процедуры обнаружения пиков в спектре. Перечислены достоинства и недостатки метода, приведены результаты тестирования.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российская академия наук - Федеральное агентство научных организаций 007-02-2014
Исследование выполнено при финансовой поддержке ФАНО России в рамках выполнения подпрограммы “Развитие селекции и семеноводства картофеля в Российской Федерации” Федеральной научно-технической программы развития сельского хозяйства на 2017–2025 гг. по теме: “Разработка программного обеспечения для генетической экспертизы сортов и сортообразцов картофеля”. Номер дополнительного государственного задания Института аналитического приборостроения РАН: № 007-02-2014 от 28.11.2017 г.
Поступила в редакцию: 27.12.2017
Англоязычная версия:
Technical Physics, 2018, Volume 63, Issue 9, Pages 1364–1369
DOI: https://doi.org/10.1134/S1063784218090244
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: И. В. Заруцкий, В. В. Манойлов, Н. С. Самсонова, А. И. Петров, В. Е. Курочкин, И. А. Леонтьев, Я. И. Алексеев, “Метод поиска пиков размерного стандарта при фрагментном анализе ДНК”, ЖТФ, 88:9 (2018), 1407–1412; Tech. Phys., 63:9 (2018), 1364–1369
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{ZarManSam18}
\by И.~В.~Заруцкий, В.~В.~Манойлов, Н.~С.~Самсонова, А.~И.~Петров, В.~Е.~Курочкин, И.~А.~Леонтьев, Я.~И.~Алексеев
\paper Метод поиска пиков размерного стандарта при фрагментном анализе ДНК
\jour ЖТФ
\yr 2018
\vol 88
\issue 9
\pages 1407--1412
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/jtf5826}
\crossref{https://doi.org/10.21883/JTF.2018.09.46429.2621}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=36904377}
\transl
\jour Tech. Phys.
\yr 2018
\vol 63
\issue 9
\pages 1364--1369
\crossref{https://doi.org/10.1134/S1063784218090244}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/jtf5826
  • https://www.mathnet.ru/rus/jtf/v88/i9/p1407
    • Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    		Журнал технической физики Журнал технической физики
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:60
    PDF полного текста:22
     
      Обратная связь:
    		  Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024