Электронно-конформационная модель рианодиновых каналов сердечной клетки

Изложены основные представления электронно-конформационной (ЭК) модели лиганд-активируемых рианодиновых каналов (RyR), в рамках которой множество степеней свободы этого гигантского наноскопического молекулярного комплекса сводится к двум, условно называемым электронной и конформационной. В простейшем варианте модели (“toy model”) конформационный потенциал, или энергетический профиль, RyR-канала представляет собой две ветви, описывающие зависимость энергии от конформационной координаты (“координаты реакции”) в исходном и лиганд-активированном состояниях соответственно. Рассмотрено обобщение модели с учетом как тетрамерной структуры RyR-канала, так и дополнительной (“ортогональной”) вращательной конформационной моды. Показано, что ЭК модель дает биофизическое обоснование традиционной феноменологической модели марковских цепей. В качестве иллюстрации возможностей ЭК модели приведены ссылки на примеры модельного описания динамики изолированных RyR-каналов и кластеров RyR-каналов в высвобождающих единицах сердечной клетки.