|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations
[Эффективная модель воды для моделирования больших молекулярных систем]
Viktor E. Zalizniakab a Institute of Mathematics and Computer Science, Siberian Federal University, Svobodny, 79, Krasnoyarsk, 660041, Russia
b Institute of Computational Modelling SB RAS, Akademgorodok, 50/44, Krasnoyarsk, 660036, Russia
Аннотация:
В статье предлагается простая и эффективная, с вычислительной точки зрения, модель воды. Эта одноточечная модель включает в себя потенциал Леннард-Джонса и усреднённое по углам диполь-дипольное взаимодействие. Для параметризации модели используются экспериментальные данные для воды при различных температурах. Основным целевым параметром была выбрана плотность воды. Параметризация проводилась в области температур от 300 до 350 K и давлений до 10.1 МПа. Свойства воды, вычисленные с помощью предлагаемой модели, сравниваются с экспериментальными данными и данными, полученными с помощью модели воды TIP4P/2005. Сравнение показывает, что предлагаемая модель достаточно хорошо воспроизводит выбранные свойства. В статье также приводится вычислительная схема метода молекулярной динамики для NPT ансамбля. Предлагаемая модель не только воспроизводит основные свойства воды, но и требует значительно меньше вычислений по сравнению со стандартными многоточечными моделями воды. Данная модель предназначена для моделирования больших молекулярных систем, возникающих в различных задачах наногидродинамики.
Ключевые слова:
модель воды, молекулярная динамика.
Получена: 10.06.2015 Исправленный вариант: 24.08.2015 Принята: 01.10.2015
Образец цитирования:
Viktor E. Zalizniak, “An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations”, Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ., 8:4 (2015), 487–496
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/jsfu452 https://www.mathnet.ru/rus/jsfu/v8/i4/p487
|
|