|
Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)
КОНДЕНСИРОВАННОЕ СОСТОЯНИЕ
Пространственные расстояния внутри скомканного полимера со случайными петлями
Б. Славов, К. Половников Сколковский институт науки и технологий, 121205 Москва, Россия
Аннотация:
В качестве минимальной модели организации хромосом была предложена модель скомканного полимера, дополнительно свернутого в случайные петли. Как петли влияют на пространственные расстояния в таком полимере? В данной работе мы исследуем статистику внутрицепочечных расстояний $R(s)$ на разных масштабах контурной длины $s$ в ансамбле полимерных конфигураций с вмороженным беспорядком петель. Мы описываем эффект петель, аналитически решая модель скомканной полимерной цепи, которая долгое время предлагалась как нулевая модель организации хроматина. Как мы показываем, цепочка компактизуется при добавлении петель и имеет характерную впадину на $R(s)$ на масштабе длины в несколько размеров петель $\lambda$. Количественно сравнивая $R(s)$ с поведением функции вероятности контакта $P_c(s)$, вычисленной нами ранее [1, 2], мы дополнительно демонстрируем нарушение известного приближения среднего поля между двумя наблюдаемыми величинами. Последний результат является ярким отражением негауссовости полимерного ансамбля, вызванным беспорядком петель. В совокупности наши теоретические выводы прокладывают путь к количественному анализу параметров хромосом с петлями из данных микроскопии in vivo и предостерегают исследователей от использования гауссовых методов анализа усредненных по популяции экспериментальных данных (например, Hi-C).
Поступила в редакцию: 15.06.2023 Исправленный вариант: 29.06.2023 Принята в печать: 30.06.2023
Образец цитирования:
Б. Славов, К. Половников, “Пространственные расстояния внутри скомканного полимера со случайными петлями”, Письма в ЖЭТФ, 118:3 (2023), 204–211; JETP Letters, 118:3 (2023), 208–214
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/jetpl7008 https://www.mathnet.ru/rus/jetpl/v118/i3/p204
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 44 | Список литературы: | 13 | Первая страница: | 5 |
|