|
Эта публикация цитируется в 7 научных статьях (всего в 7 статьях)
Биофизика и медицинская физика
Исследование статистических характеристик оптических GB-спеклов, формирующихся при рассеянии света на виртуальных структурах нуклеотидных последовательностей генов энтеробактерий
С. С. Ульяновab, О. В. Ульяноваb, С. С. Зайцевb, М. А. Хижняковаb, Ю. В. Салтыковbc, Н. Н. Филоноваbc, И. А. Субботинаcb, А. М. Ляпинаb, В. А. Федороваbc a Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского
b Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии, филиал в Саратове
c Саратовский государственный аграрный университет имени Н. И. Вавилова
Аннотация:
Представлен краткий обзор методов современной биоинформатики, основанных на использовании виртуальных оптических GB-спекл-полей (gene-based speckles) и анализе их статистических характеристик. Предложен и обсужден алгоритм преобразования нуклеотидной последовательности в двумерную GB-спекл-структуру. Проведено моделирование процессов формирования GB-спекл-структур при рассеянии когерентного света на квази-случайных поверхностях, соответствующих исходным нуклеотидным последовательностям генов, кодирующих белки семейства Omptin (SopA, OmpP, OmpT, PgtE и Pla) энтеробактерий. Исследованы статистические свойства GB-спеклов. Показана возможность выявления наличия общих мотивов указанных генов с использованием методов оптики спеклов.
Ключевые слова:
последовательности нуклеотидов, GBспеклы, референтная последовательность, дифракция когерентного света, виртуальные случайные поверхности, белки Omptin, ген.
Образец цитирования:
С. С. Ульянов, О. В. Ульянова, С. С. Зайцев, М. А. Хижнякова, Ю. В. Салтыков, Н. Н. Филонова, И. А. Субботина, А. М. Ляпина, В. А. Федорова, “Исследование статистических характеристик оптических GB-спеклов, формирующихся при рассеянии света на виртуальных структурах нуклеотидных последовательностей генов энтеробактерий”, Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика, 18:2 (2018), 123–137
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/isuph314 https://www.mathnet.ru/rus/isuph/v18/i2/p123
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 43 | PDF полного текста: | 23 | Список литературы: | 11 |
|