Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Физика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS


Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти




Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация

Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Физика, 2018, том 18, выпуск 2, страницы 123–137
DOI: https://doi.org/10.18500/1817-3020-2018-18-2-123-137 (Mi isuph314) 		 
Эта публикация цитируется в 7 научных статьях (всего в 7 статьях)

Биофизика и медицинская физика

Исследование статистических характеристик оптических GB-спеклов, формирующихся при рассеянии света на виртуальных структурах нуклеотидных последовательностей генов энтеробактерий

С. С. Ульяновab, О. В. Ульяноваb, С. С. Зайцевb, М. А. Хижняковаb, Ю. В. Салтыковbc, Н. Н. Филоноваbc, И. А. Субботинаcb, А. М. Ляпинаb, В. А. Федороваbc

a Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского
b Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии, филиал в Саратове
c Саратовский государственный аграрный университет имени Н. И. Вавилова
PDF полного текста (1498 kB) Список цитирования (7)
Список литературы:
PDF
HTML
DOI: https://doi.org/10.18500/1817-3020-2018-18-2-123-137
Аннотация: Представлен краткий обзор методов современной биоинформатики, основанных на использовании виртуальных оптических GB-спекл-полей (gene-based speckles) и анализе их статистических характеристик. Предложен и обсужден алгоритм преобразования нуклеотидной последовательности в двумерную GB-спекл-структуру. Проведено моделирование процессов формирования GB-спекл-структур при рассеянии когерентного света на квази-случайных поверхностях, соответствующих исходным нуклеотидным последовательностям генов, кодирующих белки семейства Omptin (SopA, OmpP, OmpT, PgtE и Pla) энтеробактерий. Исследованы статистические свойства GB-спеклов. Показана возможность выявления наличия общих мотивов указанных генов с использованием методов оптики спеклов.
Ключевые слова: последовательности нуклеотидов, GBспеклы, референтная последовательность, дифракция когерентного света, виртуальные случайные поверхности, белки Omptin, ген.
Финансовая поддержка Номер гранта
0615-2018-0001
Работа выполнена при финансовой поддержке ПФНИ РАН по направлению 160, тема № 0615-2018-0001 на 2018 год.
Тип публикации: Статья
УДК: 535.41
Образец цитирования: С. С. Ульянов, О. В. Ульянова, С. С. Зайцев, М. А. Хижнякова, Ю. В. Салтыков, Н. Н. Филонова, И. А. Субботина, А. М. Ляпина, В. А. Федорова, “Исследование статистических характеристик оптических GB-спеклов, формирующихся при рассеянии света на виртуальных структурах нуклеотидных последовательностей генов энтеробактерий”, Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика, 18:2 (2018), 123–137
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{UlyUliZai18}
\by С.~С.~Ульянов, О.~В.~Ульянова, С.~С.~Зайцев, М.~А.~Хижнякова, Ю.~В.~Салтыков, Н.~Н.~Филонова, И.~А.~Субботина, А.~М.~Ляпина, В.~А.~Федорова
\paper Исследование статистических характеристик оптических GB-спеклов, формирующихся при рассеянии света на виртуальных структурах нуклеотидных последовательностей генов энтеробактерий
\jour Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика
\yr 2018
\vol 18
\issue 2
\pages 123--137
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/isuph314}
\crossref{https://doi.org/10.18500/1817-3020-2018-18-2-123-137}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/isuph314
  • https://www.mathnet.ru/rus/isuph/v18/i2/p123
    • Эта публикация цитируется в следующих 7 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    		Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Физика
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:43
    PDF полного текста:23
    Список литературы:11
     
      Обратная связь:
    		  Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024