The study of interhelical distances of helical pairs in protein molecules

В данной работе проведен анализ распределения межспиральных расстояний в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Были разработаны правила отбора спиральных пар в структурах белковых молекул из Банка белковых структур (Protein Data Bank). Полученное множество спиральных пар было проанализировано с целью его классификации и установления закономерностей структурной организации. Предложена точечная модель двухспирального мотива. По критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей, полученное множество разбито на три подмножества. В работе получены гистограммы распределения всех типов спиральных пар в зависимости от расстояний между спиралями. Представлены статистические оценки распределений межплоскостного и минимального расстояний для спиральных пар различных типов, принадлежащих различным множествам.