The study of the torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules

В данной работе проведен анализ распределения торсионных углов между осями спиралей в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Исследование проводилось на множестве спиральных пар, отобранных из структур белковых молекул, представленных в PDB. Полученное множество спиральных пар было проанализировано и разбито на три подмножества по критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей. Показано, что распределение всех типов спиральных пар, не имеющих пересечений проекций спиралей, в зависимости от торсионного угла охватывает практически весь диапазон углов с двумя пиками в области 0$^\circ$ и 180$^\circ$. Распределение спиральных пар подмножества с пересечением проекций спиралей имеет максимум в области значений торсионного угла между осями спиралей в области 20$^\circ$–25$^\circ$. Образованные двумя $\alpha$-спиралями спиральные пары составляют абсолютное большинство пар подмножества с пересечением проекций и осей спиралей. Для них характерно распределение с тремя максимумами, лежащими в области острых углов: в области отрицательных значений (от –50$^\circ$ до –25$^\circ$), в области положительных значений углов (от 20$^\circ$ до 25$^\circ$) и в области прямого угла (от 70$^\circ$ до 110$^\circ$).