|
Графовое представление сценариев сборки последовательностей иммунных рецепторов
В. И. Назаров, Э. С. Клышинский
Аннотация:
В работе представлена новая методика для анализа данных, полученных из последовательностей иммунных рецепторов. Методика основана на применении графовых алгоритмов и позволяет рассчитывать вероятности сборки всех возможных сценариев как нуклеотидных, так и аминокислотных последовательностей иммунных рецепторов, а также проводить статистический вывод параметров вероятностной модели сборки. На момент написания работы, подобный подход применяется впервые в мировой практике. Разработанные алгоритмы для подсчета вероятностей и статистического вывода показывают гораздо большую скорость работы по сравнению с существующими аналогами. В работе приведены результаты численных экспериментов и исследована эффективность распараллеливания алгоритмов.
Ключевые слова:
статистическая иммуноинформатика, адаптивный иммунитет, Т-клеточные рецепторы, иммуноглобулины, V(D)J рекомбинация.
Образец цитирования:
В. И. Назаров, Э. С. Клышинский, “Графовое представление сценариев сборки последовательностей иммунных рецепторов”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2017, 108, 30 с.
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/ipmp2324 https://www.mathnet.ru/rus/ipmp/y2017/p108
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 89 | PDF полного текста: | 232 | Список литературы: | 11 |
|