|
Фундаментальная и прикладная математика, 2015, том 20, выпуск 3, страницы 33–46
(Mi fpm1651)
|
|
|
|
Геометрический подход к анализу банка данных по пространственным структурам белков (PDB)
Е. А. Вилкул, А. О. Иванов, А. С. Мищенко, Ф. Ю. Попеленский, А. А. Тужилин, К. В. Шайтан Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова
Аннотация:
В данной статье предлагается геометрический подход к анализу базы данных, содержащей информацию о пространственных структурах белков. В результате анализа были выявлены некоторые закономерности, касающиеся конформаций, а также получен список полипептидов, строение которых существенно отклоняется от типичного представления о трёхмерной структуре белка. Данные отклонения могут свидетельствовать как о возможных ошибках и дефектах интерпретационных моделей, так и о наличии неизвестных закономерностей.
Ключевые слова:
математическая модель полипептида, конформация, трёхмерная структура полипептида, геометрический анализ данных, пептидная группа, приложения теории графов.
Образец цитирования:
Е. А. Вилкул, А. О. Иванов, А. С. Мищенко, Ф. Ю. Попеленский, А. А. Тужилин, К. В. Шайтан, “Геометрический подход к анализу банка данных по пространственным структурам белков (PDB)”, Фундамент. и прикл. матем., 20:3 (2015), 33–46; J. Math. Sci., 225:4 (2017), 555–564
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/fpm1651 https://www.mathnet.ru/rus/fpm/v20/i3/p33
|
|