|
АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ
Применение упрощенного неявного метода Эйлера для решения задач электрофизиологии
А. А. Карпаевa, Р. Р. Алиевab a Московский физико-технический институт (государственный университет),
Россия, 141700, г. Долгопрудный, Институтский пер., д. 9
b Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН,
Россия, 142290, г. Пущино, ул. Институтская, д. 3
Аннотация:
Рассматривается упрощенный неявный метод Эйлера как альтернатива явному методу Эйлера, являющемуся наиболее распространенным в области численного решения уравнений, описывающих электрическую активность нервных клеток и кардиоцитов. Многие модели электрофизиологии имеют высокую степень жесткости, так как описывают динамику процессов с существенно разными характерными временами: миллисекундная деполяризации предшествует значительно более медленной гиперполяризации при формировании потенциала действия в электровозбудимых клетках. Оценка степени жесткости в работе проводится по формуле, не требующей вычисления собственных значений матрицы Якоби системы ОДУ. Эффективность численных методов сравнивается на примере типичных представителей из классов детальных и концептуальных моделей возбудимых клеток: модели Ходжкина–Хаксли для нейронов и Алиева–Панфилова для кардиоцитов. Сравнение эффективности численных методов проведено с использованием распространенных в биомедицинских задачах видов норм. Исследовано влияние степени жесткости моделей на величину ускорения при использовании упрощенного неявного метода: выигрыш во времени при высокой степени жесткости зафиксирован только для модели Ходжкина–Хаксли. Обсуждаются целесообразность применения простых методов и методов высоких порядков точности для решения задач электрофизиологии, а также устойчивость методов. Обсуждение позволяет прояснить вопрос о причинах отказа от использования высокоточных методов в пользу простых при проведении практических расчетов. На примере модели Ходжкина–Хаксли с различными степенями жесткости вычислены производные решения высших порядков и обнаружены их значительные максимальные абсолютные значения. Последние входят в формулы констант аппроксимации и, следовательно, нивелируют малость множителя, зависящего от порядка точности. Этот факт не позволяет считать погрешности численного метода малыми. Проведенный на качественном уровне анализ устойчивости явного метода Эйлера позволяет оценить вид функции параметров модели для описания границы области устойчивости. Описание границы области устойчивости, как правило, используется при априорном принятии решения о выборе величины шага численного интегрирования.
Ключевые слова:
электрофизиология, детальные модели, концептуальные модели, жесткие системы, численные методы.
Поступила в редакцию: 06.01.2020 Исправленный вариант: 18.04.2020 Принята в печать: 01.06.2020
Образец цитирования:
А. А. Карпаев, Р. Р. Алиев, “Применение упрощенного неявного метода Эйлера для решения задач электрофизиологии”, Компьютерные исследования и моделирование, 12:4 (2020), 845–864
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/crm821 https://www.mathnet.ru/rus/crm/v12/i4/p845
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 141 | PDF полного текста: | 52 | Список литературы: | 30 |
|