|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ
Конформационно-динамические свойства ДНК и подходы к физическому картированию генома
Ю. Д. Нечипуренкоab, Д. Ю. Нечипуренкоb, И. А. Ильичеваa, М. В. Головкинa, Л. А. Панченкоc, Р. В. Полозовd, С. Л. Гроховскийa a Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН, Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
b Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, Физический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы
c Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, Биологический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы
d Институт теоретической и экспериментальной биофизики, Россия, 142290, Московская область, Пущино, Московской области, ул. Институтская, д. 3
Аннотация:
Ранее нами был предложен и развит метод исследования ДНК, основанный на расщеплении двунитевых фрагментов ДНК под действием ультразвука. Были получены относительные частоты расщепления фосфодиэфирной связи во всех 16 динуклеотидах. Увеличение базы проанализированных данных до 20 тысяч нуклеотидов позволил получить относительные частоты расщепления для 256 тетрануклеотидов. Эти величины количественно характеризуют влияние последовательности нуклеотидов на конформационную динамику сахарофосфатного остова. Сейчас известны определённые типы гетерогенности сахарофосфатного остова ДНК, связанные с расщеплением ДНК различными химическими агентами или ДНКазой 1. Гетерогенность свойств молекулы ДНК может быть использована для физического картирования генома, то есть определения участков, отвечающих за регуляцию генетический экспрессии.
Ключевые слова:
ультразвуковое расщепление ДНК, динамика молекулы ДНК, подвижность молекулы ДНК, d(CpG) динуклеотид.
Поступила в редакцию: 15.11.2010
Образец цитирования:
Ю. Д. Нечипуренко, Д. Ю. Нечипуренко, И. А. Ильичева, М. В. Головкин, Л. А. Панченко, Р. В. Полозов, С. Л. Гроховский, “Конформационно-динамические свойства ДНК и подходы к физическому картированию генома”, Компьютерные исследования и моделирование, 2:4 (2010), 419–428
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/crm615 https://www.mathnet.ru/rus/crm/v2/i4/p419
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 82 | PDF полного текста: | 44 | Список литературы: | 16 |
|