|
АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ
Распределение мононуклеотидных повторов в бактериальных хромосомах: A/T-треки преобладают над G/C-треками
С. С. Кисилев, В. М. Комаров, И. С. Масулис, О. Н. Озолинь Учреждение Российской академии наук Институт биофизики клетки РАН, 142290, Московская обл., г. Пущино, ул. Институтская, д. 3
Аннотация:
В данной работе исследовано распределение мононуклеотидных треков разной длины в 342 хромосомах эубактерий и 69 хромосомах архей. Несмотря на то, что число анализируемых повторов проявляет зависимость от нуклеотидного состава, в 73% случаев (301 хромосома, в том числе и в 90 хромосомах, обогащенных GC-парами) было обнаружено преобладание poly(dA)$_n$- и poly(dT)$_n$-треков над poly(dG)$_n$- и poly(dC)$_n$-треками. В природных ДНК число А/Т-треков чаще всего в 2 раза выше, чем в случайных нуклеотидных последовательностях с аналогичным AT/GC- составом и длиной. Обсуждаются возможные причины появления подобной асимметрии в распределениях.
Ключевые слова:
мононуклеотидные повторы, A/T-треки, G/C-треки.
Поступила в редакцию: 26.05.2010
Образец цитирования:
С. С. Кисилев, В. М. Комаров, И. С. Масулис, О. Н. Озолинь, “Распределение мононуклеотидных повторов в бактериальных хромосомах: A/T-треки преобладают над G/C-треками”, Компьютерные исследования и моделирование, 2:2 (2010), 183–187
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/crm593 https://www.mathnet.ru/rus/crm/v2/i2/p183
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 98 | PDF полного текста: | 25 | Список литературы: | 24 |
|