Компьютерные исследования и моделирование
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Компьютерные исследования и моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Компьютерные исследования и моделирование, 2010, том 2, выпуск 1, страницы 63–72
DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2010-2-1-63-72
(Mi crm580)
 

Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Смешанный алгоритм расчета динамики переноса заряда в ДНК на больших временных интервалах

Н. С. Фиалко

Учреждение Российской академии наук Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Московская обл., Пущино, ул. Институтская 4
Список литературы:
Аннотация: Перенос заряда в ДНК моделируется с помощью дискретной модели Холстейна «квантовая частица + классическая цепочка сайтов + взаимодействие». Влияние температуры термостата учитывается с помощью случайной силы, действующей на классические сайты (уравнение Ланжевена). Таким образом, динамика распространения заряда вдоль цепочки описывается системой ОДУ со случайной правой частью. Для интегрирования таких систем обычно применяют алгоритмы 1 или 2 порядка. Мы разработали смешанный алгоритм, имеющий 4 порядок точности по быстрым «квантовым» переменным (заметим, что в «квантовой» подсистеме должно соблюдаться условие: «сумма вероятностей нахождения заряда на сайте постоянна по времени») и 2 порядок по медленным «классическим» переменным, на которые действует случайная сила. Алгоритм позволяет считать на бóльших временах, чем стандартные. В качестве примера приведен модельный расчет развала полярона в однородной цепочке под действием температурных флуктуаций.
Ключевые слова: ДНК, модель Холстейна, уравнение Ланжевена, алгоритм интегрирования ОДУ со случайной правой частью.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 09-07-12073
10-07-00112
Работа выполнена при частичной поддержке РФФИ, гранты No 09-07-12073, 10-07-00112.
Поступила в редакцию: 15.03.2010
Тип публикации: Статья
УДК: 519.688; 519.62; 538.9; 51-76
Образец цитирования: Н. С. Фиалко, “Смешанный алгоритм расчета динамики переноса заряда в ДНК на больших временных интервалах”, Компьютерные исследования и моделирование, 2:1 (2010), 63–72
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Fia10}
\by Н.~С.~Фиалко
\paper Смешанный алгоритм расчета динамики переноса заряда в ДНК на больших временных интервалах
\jour Компьютерные исследования и моделирование
\yr 2010
\vol 2
\issue 1
\pages 63--72
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/crm580}
\crossref{https://doi.org/10.20537/2076-7633-2010-2-1-63-72}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm580
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm/v2/i1/p63
  • Эта публикация цитируется в следующих 3 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Компьютерные исследования и моделирование
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:72
    PDF полного текста:30
    Список литературы:19
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024