Компьютерные исследования и моделирование
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Компьютерные исследования и моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Компьютерные исследования и моделирование, 2014, том 6, выпуск 5, страницы 761–774
DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2014-6-5-761-774
(Mi crm357)
 

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Молекулярная модель образования комплекса ОСР с фикобилисомой

Д. В. Зленкоa, И. Н. Стадничукb, П. М. Красильниковa

a Биологический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 119991, г. Москва, Воробьёвы горы, 1/12
b Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН, Россия, 119071, г. Москва, Ленинский проспект, д. 33
Список литературы:
Аннотация: Построена молекулярная модель взаимодействия фикобилисомыс ОСР, белком-тушителем, регулирующим передачу энергии от фикобилисом к фотосистемам в пигментном аппарате цианобактерий. Полученная модель не требует нарушения известной по рентгеноструктурным данным пространственной структуры взаимодействующих белков, а также позволяет удовлетворительно описать процесс переноса энергии к ОСР от фикобилисомы. Методом MM-PBSAрассчитана свободная энергия образования комплекса. Показано, что свободная энергия имеет величину не более нескольких десятков кДж/моль, что хорошо согласуется с наблюдаемой в эксперименте небольшой устойчивостью комплекса. Показано, что удельная свободная энергия взаимодействия рассматриваемых в модели весьма гидрофильных белков друг с другом при-мерно в два раза превышает удельную энергию их взаимодействия с водой, что свидетельствует о высокой комплементарности контактирующих белковых поверхностей и является сильным аргументом в пользу предложенной модели.
Ключевые слова: фикобилисома, комплексоообразование, молекулярное моделирование, свободная энергия.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 14-14-00589
Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда, грант No 14-14-00589. Все расчеты выполнены с использованием суперкомпьютеров «Ломоносов» и «Чебышёв» НИВЦ МГУ
Поступила в редакцию: 24.07.2014
Исправленный вариант: 18.08.2014
Тип публикации: Статья
УДК: 577.31, 577.32, 577.34
Образец цитирования: Д. В. Зленко, И. Н. Стадничук, П. М. Красильников, “Молекулярная модель образования комплекса ОСР с фикобилисомой”, Компьютерные исследования и моделирование, 6:5 (2014), 761–774
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{ZleStaKra14}
\by Д.~В.~Зленко, И.~Н.~Стадничук, П.~М.~Красильников
\paper Молекулярная модель образования комплекса ОСР с фикобилисомой
\jour Компьютерные исследования и моделирование
\yr 2014
\vol 6
\issue 5
\pages 761--774
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/crm357}
\crossref{https://doi.org/10.20537/2076-7633-2014-6-5-761-774}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm357
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm/v6/i5/p761
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Компьютерные исследования и моделирование
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:99
    PDF полного текста:47
    Список литературы:25
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024