Компьютерные исследования и моделирование
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS


Компьютерные исследования и моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти




Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация

Компьютерные исследования и моделирование, 2015, том 7, выпуск 2, страницы 347–359
DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2015-7-2-347-359 (Mi crm192) 		 
АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Определение промоторных и непромоторных последовательностей $E.coli$ по профилям их электростатического потенциала

Е. А. Темлякова, А. А. Сорокин

Институт биофизики клетки РАН, Россия, 142290, г. Пущино, ул. Институтская, д. 3
PDF полного текста (208 kB)
Список литературы:
PDF
HTML
DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2015-7-2-347-359
Аннотация: В рамках данной работы была продемонстрирована возможность использования характеристик профилей электростатического потенциала вдоль последовательностей ДНК для определения их функционального класса. Построены модели, позволяющие разделять промоторные и непромоторные последовательности (случайные бернуллиевские, кодирующие и псевдопромоторы) с точностью порядка 83-85 %. Определены наиболее значимые участки для такого разделения, по-видимому играющие важную роль при ДНК-полимеразном узнавании.
Ключевые слова: электростатические свойства ДНК, поиск промоторов, VIP-анализ.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 14-04-31793-мол_а
14-44-03679-р_центр_а.
Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта No14-04-31793-мол_а, а также совместно РФФИ и Московской областью в рамках научного проекта No14-44-03679-р_центр_а.
Поступила в редакцию: 16.09.2013
Исправленный вариант: 26.01.2015
Тип публикации: Статья
УДК: 519.8
Образец цитирования: Е. А. Темлякова, А. А. Сорокин, “Определение промоторных и непромоторных последовательностей $E.coli$ по профилям их электростатического потенциала”, Компьютерные исследования и моделирование, 7:2 (2015), 347–359
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TemSor15}
\by Е.~А.~Темлякова, А.~А.~Сорокин
\paper Определение промоторных и непромоторных последовательностей
$E.coli$ по профилям их электростатического потенциала
\jour Компьютерные исследования и моделирование
\yr 2015
\vol 7
\issue 2
\pages 347--359
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/crm192}
\crossref{https://doi.org/10.20537/2076-7633-2015-7-2-347-359}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm192
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm/v7/i2/p347
    • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    		Компьютерные исследования и моделирование
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:84
    PDF полного текста:33
    Список литературы:22
     
      Обратная связь:
    		  Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024