|
АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ
Определение промоторных и непромоторных последовательностей
$E.coli$ по профилям их электростатического потенциала
Е. А. Темлякова, А. А. Сорокин Институт биофизики клетки РАН, Россия, 142290, г. Пущино, ул. Институтская, д. 3
Аннотация:
В рамках данной работы была продемонстрирована возможность использования характеристик профилей электростатического потенциала вдоль последовательностей ДНК для определения их функционального класса. Построены модели, позволяющие разделять промоторные и непромоторные последовательности (случайные бернуллиевские, кодирующие и псевдопромоторы) с точностью порядка 83-85 %. Определены наиболее значимые участки для такого разделения, по-видимому играющие важную роль при ДНК-полимеразном узнавании.
Ключевые слова:
электростатические свойства ДНК, поиск промоторов, VIP-анализ.
Поступила в редакцию: 16.09.2013 Исправленный вариант: 26.01.2015
Образец цитирования:
Е. А. Темлякова, А. А. Сорокин, “Определение промоторных и непромоторных последовательностей
$E.coli$ по профилям их электростатического потенциала”, Компьютерные исследования и моделирование, 7:2 (2015), 347–359
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/crm192 https://www.mathnet.ru/rus/crm/v7/i2/p347
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 96 | PDF полного текста: | 38 | Список литературы: | 32 |
|