Компьютерные исследования и моделирование
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Компьютерные исследования и моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Компьютерные исследования и моделирование, 2023, том 15, выпуск 6, страницы 1653–1672
DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2023-15-6-1653-1672
(Mi crm1140)
 

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Идентификация параметров вязкоупругих моделей клетки на основе силовых кривых и вейвлет-преобразования

А. С. Никитюк

Институт механики сплошных сред УрО РАН, Россия, 614013, г. Пермь, ул. Академика Королёва, д. 1
Список литературы:
Аннотация: Механические свойства клеток эукариот играют важную роль в условиях жизненного цикла и при развитии патологических процессов. В работе обсуждается проблема идентификации и верификации параметров вязкоупругих конститутивных моделей на основе данных силовой спектроскопии клеток эукариот. Предлагается использовать одномерное непрерывное вейвлет-преобразование для расчета ядра релаксации. Приводятся аналитические выкладки и результаты численных расчетов, позволяющие на основе экспериментально установленных силовых кривых и теоретических зависимостей «напряжение – деформация» с применением алгоритмов вейвлет-дифференцирования получать аналогичные друг другу функции релаксации. Анализируются тестовые примеры, демонстрирующие корректности программной реализации предложенных алгоритмов. Рассматриваются модели клетки, на примере которых демонстрируется применение предложенной процедуры идентификации и верификации их параметров. Среди них структурно-механическая модель с параллельно соединенными дробными элементами, которая является на данный момент наиболее адекватной с точки зрения соответствия данным атомно-силовой микроскопии широкого класса клеток, и новая статистико-термодинамическая модель, которая не уступает в описательных возможностях моделям с дробными производными, но имеет более ясный физический смысл. Для статистико-термодинамической модели подробно описывается процедура ее построения, которая в себя включает следующее: введение структурной переменной, параметра порядка, для описания ориентационных свойств цитоскелета клетки; постановку и решение статистической задачи для ансамбля актиновых филаментов представительного объема клетки относительно данной переменной; установление вида свободной энергии, зависящей от параметра порядка, температуры и внешней нагрузки. Также предложено в качестве модели представительного элемента клетки использовать ориентационно-вязкоупругое тело. Согласно теории линейной термодинамики получены эволюционные уравнения, описывающие механическое поведение представительного объема клетки, которые удовлетворяют основным термодинамическим законам. Также поставлена и решена задача оптимизации параметров статистико-термодинамической модели клетки, которая может сопоставляется как с экспериментальными данными, так и с результатами симуляций на основе других математических моделей. Определены вязкоупругие характеристики клеток на основе сопоставления с литературными данными.
Ключевые слова: вязкоупругость, механика клетки, вейвлет-преобразование, реологические модели с дробными операторами, статистическая термодинамика, ядро релаксации
Финансовая поддержка Номер гранта
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации АААА-А19-119013090021-5
Министерство образования и науки Российской Федерации МК-44.2022.1.1
Работа выполнена при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (государственный контракт № АААА-А19-119013090021-5), а также поддержана грантом Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых (№ МК-44.2022.1.1).
Поступила в редакцию: 30.09.2023
Исправленный вариант: 20.11.2023
Принята в печать: 20.11.2023
Тип публикации: Статья
УДК: 577.35
Образец цитирования: А. С. Никитюк, “Идентификация параметров вязкоупругих моделей клетки на основе силовых кривых и вейвлет-преобразования”, Компьютерные исследования и моделирование, 15:6 (2023), 1653–1672
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Nik23}
\by А.~С.~Никитюк
\paper Идентификация параметров вязкоупругих моделей клетки на основе силовых кривых и вейвлет-преобразования
\jour Компьютерные исследования и моделирование
\yr 2023
\vol 15
\issue 6
\pages 1653--1672
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/crm1140}
\crossref{https://doi.org/10.20537/2076-7633-2023-15-6-1653-1672}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm1140
  • https://www.mathnet.ru/rus/crm/v15/i6/p1653
  • Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Компьютерные исследования и моделирование
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024