Операционные графы, применение теории графов в интерфейсах на естественном языке к БД, онтологических интерфейсах, модели многоагентных систем.

• M. Samsonova, A. Pisarev, K. Kozlov, E. Poustelnikova, A. Tkachenko. An Information Management System for Collaboration Within Distributed Working Environment. Lecture Notes in Computer Science, Springer Berlin, Volume 4075/2006, 2006, p. 204–215.
• A. Pisarev, M. Blagov, E. Poustelnikova, E. Myasnikova, M. Samsonova. A system for on-line processing and analysis of images of gene expression patterns. Pattern Recognition and Image Analysis: Advances in Mathematical Theory and Applications, 2005, v. 15, No 2.
• E. Poustelnikova, A. Pisarev, M. Blagov, M. Samsonova, and J. Reinitz. A database for management of gene expression data in situ. Bioinformatics, 2004, 20, 14, 2212–2221.
• A. Pisarev, E. Poustelnikova, K. Kozlov, E. Myasnikova, M. Samsonova, and J. Reinitz. ImageServer, a Tool for On-line Processing and Analysis of Biological Images. J. of Integrative Bioinformatics, Yearbook in Bioinformatics 2005, R. Hofestaedt ed., 15–25.
• A. Pisarev, E. Poustelnikova, M. Samsonova, P. Baumann. Mooshka: a system for management of multidimensional gene expression data in situ. Information Systems, 2003, v. 28, No 4, 269–285.

• Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого