ОАО "НИИТФА" является научно-производственным объединением и выступает в качестве головного исполнителя по НИОКР, выполняемых по ряду федеральных и отраслевых программ, в том числе в рамках Федеральных целевых программ "Национальная технологическая база", "Ядерные энерготехнологии нового поколения", а также отраслевых программ по безопасности атомной энергетики, по ядерному топливному циклу, высокотехнологичной медтехники и экологии.