В настоящее время университет является крупным учебным и научным центром Республики Каракалпакстан, отвечающим требованиям международных стандартов.

В университете 16 факультетов, из них 14 очных, на которых получают образование около 4700 студентов по 32 направлениям бакалавриатуры и 26 специальностям магистратуры, на 3 заочных факультетах по 20 направлениям бакалавриатуры обучаются свыше 2100 студентов, не отрываясь от производства. За последние 30 лет университет подготовил свыше 30000 высококвалифицированных специалистов. Специалисты, окончившие университет, успешно работают во всех сферах народного хозяйства республики.

В университете функционируют 49 кафедр, где работают свыше 575 человек, из них свыше 35 докторов наук и профессоров, свыше 180 кандидатов наук и доцентов. Профессорско-преподавательский состав университета наряду с обучением студентов проводит научно-исследовательскую и учебно-методическую работу.

В развитии научно-исследовательской работы большое значение имеют международные совместные научные исследования, развитие научных связей с крупными учебными и научными центрами зарубежных стран. С целью подготовки специалистов и научно-педагогических кадров имеются совместные договора с крупными университетами и научными центрами США, Великобритании, Франции, Германии, Швеции, Болгарии, Малайзии, Китая, Турции, России, Украины и других государств.