Санкт-Петербургский университет был основан Петром I в задуманной им целостной системе науки и образования в России, в которой были объединены Академия наук, университет и гимназия.

Первоначально в воссозданном университете было три факультета: историко-филологический, философо-юридический (позднее юридический) и физико-математический, которые делились на разряды; в 1854 г. к ним добавился факультет восточных языков. В таком составе университет просуществовал до 1918 г.

В 1960-е годы были открыты новые факультеты (психологии, журналистики, прикладной математики-процессов управления) и ряд новых кафедр на других факультетах. Тогда же началось строительство новых зданий для естественно-научных факультетов в районе Старого Петергофа.

Являясь родиной большого количества научных школ и направлений, носителем гуманистических и демократических традиций, университет в Санкт-Петербурге является ныне подлинным российским и мировым центром образования, науки и культуры.

• Институт физиологии им. акад. А. А. Ухтомского Санкт-Петербургского государственного университета
• Исследовательская лаборатория им. П. Л. Чебышева, Санкт-Петербургский государственный университет, математико-механический факультет
• Санкт-Петербургский государственный университет, Биологический факультет
• Высшая школа менеджмента Санкт-Петербургского государственного университета
• Институт химии Санкт-Петербургского государственного университета
• Институт наук о Земле Санкт-Петербургского государственного университета
• Междисциплинарный центр дополнительного профессионального образования Санкт-Петербургского государственного университета
• Междисциплинарный ресурсный центр по направлению ``Нанотехнологии'', С.-Петербургский государственный университет
• Лаборатория "Современная алгебра и приложения", Санкт-Петербургский государственный университет
• Менделеевский центр Санкт-Петербургского государственного университета
• Ресурсный центр "Нанофотоника", Санкт-Петербургский государственный университет
• Российский центр лазерной физики, Научно-исследовательский институт Санкт-Петербургского государственного университета
• Санкт-Петербургский государственный университет, факультет математики и компьютерных наук
• Лаборатория Оптики спина имени И.Н. Уральцева, Санкт-Петербургский государственный университет
• Ресурсный центр "Оптические и лазерные методы исследования вещества", Санкт-Петербургский государственный университет
• Санкт-Петербургский государственный университет, Научно-исследовательский институт химии
• Санкт-Петербургский государственный университет, экономический факультет
• Санкт-Петербургский государственный университет, факультет прикладной математики — процессов управления
• Санкт-Петербургский государственный университет, факультет свободных искусств и наук
• Санкт-Петербургский государственный университет, физический факультет
• Санкт-Петербургский государственный университет, математико-механический факультет
• Научно-исследовательский институт математики и механики им. акад. В. И. Смирнова Санкт-Петербургского государственного университета
• Санкт-Петербургский государственный университет, Научно-исследовательский институт радиофизики
• Ресурсный центр "Физические методы исследования поверхности", Санкт-Петербургский государственный университет
• Научно-исследовательский институт вычислительной математики и процессов управления им. В. И. Зубова Санкт-Петербугского государственного университета
• Астрономический институт им. В. В. Соболева Санкт-Петербургского университета

• Ленинградский государственный университет
• Ленинградский государственный университет им. А. А. Жданова