Институт математики организован 1 сентября 1965 г. С 1965 г. по февраль 1992 г. — Институт математики и механики; с марта 1992 г. по 8 марта 1999 г. — Институт теоретической и прикладной математики; с 9 марта 1999 г. — Институт математики.

В 2005 г. исполнилось 40 лет со дня организации Института математики. Его предыстория начинается с момента создания в 1945 году Сектора математики и механики Академии наук Казахской ССР.

За 40-летний период существования Институт сыграл значительную роль в развитии математической науки, а также в подготовке для республики высококвалифицированных кадров в области математики, механики и информатики.

В своем развитии Институт подготовил основу и отделил от себя 5 новых институтов: сейсмологии (1976 г.), космических исследований (1991 г.), проблем управления и информатики (1991 г.), механики и машиноведения (1991 г.), прикладной математики (1991 г.).

В 2004 г. Институт математики получает статус дочернего государственного предприятия Центра физико-математических исследований Министерства образования и науки Республики Казахстан на правах хозяйственного ведения.

На 1 июля 2005 г. в соответствии с программами фундаментальных исследований Институт структурно представлен десятью лабораториями: функционального анализа (д.ф.-м.н. Б. Л. Байдельдинов), теории аппроксимации (акад. А. А. Женсыкбаев), дифференциальных уравнений (д.ф.-м.н. Д. С. Джумабаев), алгебры и математической логики (акад. А. С. Джумадильдаев), динамических систем (д.ф.-м.н. М. И. Рахимбердиев), уравнений математической физики (д.ф.-м.н. М. Т. Дженалиев), дифференциальных систем и моделирования (акад. Т. Ш. Кальменов), волновой динамики (д.ф.-м.н. Л.А.Алексеева), гидродинамики (д.ф.-м.н. А. Ж. Найманова), компьютерного моделирования (д.т.н. И. Т. Пак) и Компьютерным центром (к.ф.-м.н. Т. М. Такабаев).

Всего работают 128 человек, в том числе 28 докторов, 38 кандидатов, 4 академика, 2 Заслуженных деятеля науки и техники РК.

Сотрудники Института являются обладателями Международной стипендии им. Фон Гумбольдта, Международной премии им. Хорезми, грантов Сороса, INTAS, Американского математического общества, МНТЦ, Министерства исследований Франции и др. В 1998 г. на базе Института в Республике создан Национальный комитет математики Казахстана (с 1994 г. Казахстан является членом Международного математического общества, с 1998 г. членом Международного математического общества стран Азии).

• Институт математики и механики АН КазССР
• Институт математики и механики НАН Казахстана
• Институт математики, информатики и механики
• Институт математики МОН Республики Казахстан
• Институт теоретической и прикладной математики
• Институт теоретической и прикладной математики Национальной академии наук Республики Казахстан