Наманганский государственный университет образован Указом Президента Республики Узбекистан от 28 февраля 1992 года на базе Наманганского государственного педагогического института. Университет вначале был основан как филиал Андижанского учительского института в 1942 году, который в 1944 году был преобразован в учительский институт, а в 1955 году — в Наманганский государственный педагогический институт.

За прошедшие годы университет подготовил для экономики республики почти 28 тысяч высококвалифицированных кадров. Развитие университета на современным этапе исключительно связано с политикой правительства республики по развитию системы образования в стране, в частности, с претворением в жизнь Национальной Программы по подготовке кадров.

В университете функционируют 6 факультетов и 28 кафедр. Имеется научная библиотека с книжным фондом в 476,5 тыс. единиц. Студентов обслуживает центр информационных технологий.